A Mesa Diretora é responsável por coordenar e dirigir as atividades legislativas e administrativas da casa. Ela é composta por um grupo de vereadores eleitos pelos demais membros da Câmara para conduzir os trabalhos.

O presidente é o responsável por conduzir as sessões legislativas e administrar os trabalhos da Câmara, enquanto o vice-presidente o auxilia em suas atribuições. Já os secretários são encarregados da organização e redação dos documentos da casa legislativa, como atas e resoluções. A nova composição da Mesa Diretora da Câmara de Bonópolis busca aprimorar a eficiência e a transparência dos trabalhos da casa, além de garantir o compromisso com a população do município.